Aptekarz Jeana Vebera to francuski thriller z elementami horroru, w którym cichy paryski farmaceuta-ekolog skrywa drugą, znacznie mroczniejszą twarz. Tropiący seryjnego truciciela policjant nie podejrzewa, że właśnie zaprzyjaźnił się z człowiekiem, którego szuka.

Yan Lazarrec (Vincent Perez) prowadzi spokojną paryską aptekę i uchodzi za człowieka łagodnego, zaangażowanego w sprawy ekologii. Pod tą fasadą kryje się jednak ktoś zupełnie inny — aptekarz po godzinach preparuje wyrafinowane trucizny i wymierza sprawiedliwość na własną rękę, biorąc na cel biznesmenów i osoby, które uznaje za odpowiedzialne za niszczenie środowiska. Sięga przy tym po starożytne, niemal druidyczne receptury, nadające jego misji groteskowy, mroczny rys.

Tropem tajemniczych zgonów rusza komisarz François Barrier (Guillaume Depardieu), również wrażliwy na kwestie ekologiczne. Obaj mężczyźni poznają się przypadkiem na konferencji o ochronie środowiska i szybko zawiązują nić sympatii, nieświadomi, że ich drogi prędzej czy później muszą się zderzyć. W tle pojawia się Mathilde (Clara Bellar), a akcja stopniowo przenosi się z Paryża w surowy, niemal baśniowy krajobraz bretońskiej prowincji.